Я сменил фамилию после того, как подал заявление на получение румынского гражданства, мне теперь по новой подавать документы?

Да, в файл досье придется вводить новые данные, иначе как вы получите паспорт с другой фамилией? Думаю в этом вопросе Вам сможет помочь компания International Business, у них большой опыт по оформлению гражданства Румынии. Рекомендую посмотреть видео канал о том как получить румынское гражданство Вам будет интересно